审计人员应当记录形成结论时如何处理该矛盾或不一致的情况。记录的内容应当包括为解决问题而执行的所有程序，包括针对该信息执行的审计程序、项目组成员对某事项的职业判断不同而向技术部门的咨询情况等。编制审计工作底稿一方面是为出具审计报告提供充分适当的记录，另一方面，审计工作底稿也可以作为审计人员已按照审计准则和相关法律法规的规定计划和执行了审计工作的证据，可以说是审计人员自证清白的证据，所以审计工作底稿的过程记录往往是越详细越好。
高新技术企业在审计的过程中，企业合作的会计师事务所必须严格按
高新技术企业在审计的过程中，企业合作的会计师事务所必须严格按照审计准则执行审计程序，获取充分适当的审计证据、高新技术产品（服务）收入的佐证材料；在对科研费用的认定与归集上，能从产品立项和预算管理、人员管理、设备及材料管理、委托外部研究开发管理、结项管理等流程分析中识别研究开发费用的关键控制点，对研究开发费用实施了进一步审计程序。当然也有部分事务所不能按照上述要求去执行，汇算清缴，既而为整个审计报告的性和高新技术企业申报的通过率带来一定的安全隐患。
在企业审计时，审计的重点是收入的完整性、费用的合理性以及税金的缴纳，审计主要通过查看资金流水明细账、购销合同、应收应付明细，汇算清缴费用，原材料明细和产成品明细、费用明细等来检验会计记录的真实性，通过对这些科目的审计，多数问题就会暴露出来。那什么样的数据是反常的，值得被怀疑的呢？现今的网络时代环境，津南汇算清缴，现金的交易越来越少，除了与自然人的交易外，企业与企业之间有大量或者大额现金交易，就值得注意了。
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