水源的水质决定了纯水设备的生产工艺，不同地区的水质相差也是很大的，水质越差的地方，设备的生产工艺成本就越高，从而增加了设备的制造成本，提高了设备的价格。
一般情况下纯水设备选用的是耐磨耐腐蚀的材质，不会生锈，可以避免设备在制水过程与水产生接触后产生的一些普通材质上的生锈，设备的使用寿命越长就表明价格越贵。
纯化水设备运行管理不严。系统运行时，纯化水设备订购，压力要处于膜的可承受的工作压力范围，防止超负荷运行，使膜产生机械性损伤，导致泄漏发生。当反渗透系统运行一段时间后，出现制水量锐减，制水水质恶化或者压差提升时，说明膜已需要清洗，此时应将机器转换成清洗状态，使系统自行清洗，即可恢复膜的功能。
超纯水机的制取速度远远高于传统的纯水制取设备，已经成为各个用水行业的实验室制水设备之一了，不同的超纯水机制取出的超纯水虽然水质有所不同，但是在水质维持上基本是相同的
纯化水系统所用的的储存罐和管道凡是纯化水接触的材料一般采316L或其他与之性能相符的材料如有更高抗热性的聚偏氟乙烯(PVDF)，系统材质可选一种，其优点可为定期钝化操作带来便利，在纯化水系统中采有无脱落的制药级别的材质作为密封材质，纯化水设备工厂，如硅胶或三元乙丙橡胶，通常在反渗透(RO)之前，纯水设备订购，从成本的角度考虑，可以使用较便宜的塑料如聚丙希(PP)和聚氯乙希(PVC) 等。
同时，与纯化水接触的设备及管道表面应采用电抛光并进行酸洗钝化处理，抛光的方式有电解抛光及机械抛光，东莞纯化水设备，电解抛光在制水系统抛光工艺。经电抛光钝化处理的设备光洁度可做到0.5pm以下，表面形成氧化膜，提高抗腐蚀能力，减少了微生物在表面滞留。粗糙度越小越好，一个基于合理成本的范围应是0.4~1μm。
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