一、企业注册登记表信息不全/有误
高新技术企业认定管理工作网新旧版本更替会出现信息显示不全，已填写信息不显示等问题，尤其注意高企复审和当年申报非当年注册的企业。
常见问题：注册资金和注册资本不符，所属行业空白，技术领域空白，是否属于国家级高新技术企业空白。
二、主要情况表数字有误
近三年经营情况数字与审计报告不对应，基础投入研发费用无证明材料应填写为0。
常见错误：利润总额填写为净利润的数字，基础投入研发费用填写数字无说明材料。
三、人力资源情况表前后不符
1. 总体情况和全体人员结构数字不一致；
2. 整本材料体现人员情况的位置包括：人力资源情况表、创业创新能力中管理与科技人员情况、人员花名册、所得税纳税申报表中企业基础信息表，前后应保持一致。
四、研究开发活动情况表
1. 所属高新技术领域不完整或未到四级目录；
2. 研发经费支出填写位置与研发项目时间冲突；
3. 研发项目中研发经费支出与研发费用结构明细表不一致，研发费用结构明细表与专项审计报告不一致。